Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDB1Q16531 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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