Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
E2F4Q16254 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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