Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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SCN9AQ15858 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SCN9AQ15858 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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SCN9AQ15858 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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SCN9AQ15858 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCN9AQ15858 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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