Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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