Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SF1Q15637 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SF1Q15637 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SF1Q15637 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SF1Q15637 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms