Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RYR3Q15413 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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