Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDK3Q15120 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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