Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PDK1Q15118 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDK1Q15118 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms