Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARHGEF6Q15052 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARHGEF6Q15052 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms