Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
R3HDM1Q15032 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
R3HDM1Q15032 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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