Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHPRHQ149N8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SHPRHQ149N8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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