Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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NR1D2Q14995 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NR1D2Q14995 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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