Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3AQ14563 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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