Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPARCL1Q14515 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPARCL1Q14515 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPARCL1Q14515 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPARCL1Q14515 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPARCL1Q14515 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms