Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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NCOA4Q13772 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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NCOA4Q13772 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCOA4Q13772 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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