Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PEX6Q13608 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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