Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NAE1Q13564 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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NAE1Q13564 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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NAE1Q13564 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NAE1Q13564 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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