Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1Q13541 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms