Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAD4Q13485 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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