Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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MKRN4PQ13434 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MKRN4PQ13434 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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