Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
UBE2V1Q13404 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms