Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRSQ13332 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRSQ13332 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms