Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRSF6Q13247 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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