Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHAF1BQ13112 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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