Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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