Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF2Q12933 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF2Q12933 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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