Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CGNL1Q0VF96 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CGNL1Q0VF96 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms