Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSRP1Q08945 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms