Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC3A1Q07837 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms