Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SCN1BQ07699 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms