Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LTBQ06643 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBQ06643 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms