Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EXOSC9Q06265 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EXOSC9Q06265 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms