Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKCDQ05655 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms