Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EMX2Q04743 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms