Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM3Q01628 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms