Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSG4Q00888 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms