Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXC5Q00444 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms