Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXO4P98177 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXO4P98177 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXO4P98177 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms