Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGD1P98174 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FGD1P98174 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms