Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNRPNP63162 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNRPNP63162 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms