Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RPS28P62857 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RPS28P62857 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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