Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DCDC1P59894 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DCDC1P59894 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms