Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CABP4P57796 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CABP4P57796 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABP4P57796 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABP4P57796 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CABP4P57796 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CABP4P57796 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CABP4P57796 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms