Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EEFSECP57772 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms