Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2BFSP57053 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms