Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A1P53007 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms