Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRE11P49959 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms