Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSEN1P49768 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSEN1P49768 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms