Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP4P49662 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP4P49662 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP4P49662 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP4P49662 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms