Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNTAP49354 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNTAP49354 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNTAP49354 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms